Protein–RNA interactions for Protein: O00233

PSMD9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD9O00233 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.1
PSMD9O00233 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PSMD9O00233 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms