Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GOLGA8SH3BPF8 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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