Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
E9PBE3 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
E9PBE3 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
E9PBE3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
E9PBE3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms