Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CLDN25C9JDP6 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms