Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ERVV-1B6SEH8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ERVV-1B6SEH8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms