Protein–RNA interactions for Protein: R4GMW8

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BIVM-ERCC5R4GMW8 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
BIVM-ERCC5R4GMW8 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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BIVM-ERCC5R4GMW8 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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BIVM-ERCC5R4GMW8 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
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BIVM-ERCC5R4GMW8 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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BIVM-ERCC5R4GMW8 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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BIVM-ERCC5R4GMW8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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BIVM-ERCC5R4GMW8 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
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BIVM-ERCC5R4GMW8 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
BIVM-ERCC5R4GMW8 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
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