Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4X4

KLF12, Krueppel-like factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF12Q9Y4X4 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC13.33□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
KLF12Q9Y4X4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
KLF12Q9Y4X4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms