Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
HDGFL3Q9Y3E1 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
HDGFL3Q9Y3E1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms