Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms