Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
IFT52Q9Y366 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms