Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TNNQ9UQP3 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms