Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNF0

PACSIN2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN2Q9UNF0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN2Q9UNF0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PACSIN2Q9UNF0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PACSIN2Q9UNF0 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms