Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
PADI1Q9ULC6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PADI1Q9ULC6 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms