Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CYTH4Q9UIA0 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms