Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KDM5BQ9UGL1 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms