Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE2

TSHZ2, Teashirt homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,034 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHZ2Q9NRE2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSHZ2Q9NRE2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms