Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUOX2Q9NRD8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX2Q9NRD8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms