Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN8

C20orf27, UPF0687 protein C20orf27, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C20orf27Q9GZN8 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C20orf27Q9GZN8 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms