Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
KLHL4Q9C0H6 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms