Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
NUP58Q9BVL2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms