Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SGIP1Q9BQI5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms