Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TBC1D24-207ENST00000627285 4382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC9.96□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SMARCA5-201ENST00000283131 7923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EDEM3-201ENST00000318130 6898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
LINC00208Q96KT6 FASN-206ENST00000634990 8407 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms