Protein–RNA interactions for Protein: Q96KF2

PRAC1, Small nuclear protein PRAC1, humanhuman

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAC1Q96KF2 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ALDH3A2-201ENST00000176643 3928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SLC25A25-203ENST00000373068 3431 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ANKMY1-206ENST00000401804 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RBM15-202ENST00000487146 3316 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RBMS1-201ENST00000348849 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SMARCA2-209ENST00000382203 5867 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ATE1-201ENST00000224652 4930 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 R3HDM2-204ENST00000402412 4372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 C1orf167-202ENST00000433342 4545 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AL033529.1-201ENST00000480336 3447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PIM2-201ENST00000376509 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 FZD7-201ENST00000286201 3859 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 CACNA1G-229ENST00000514181 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 PNPO-217ENST00000642017 3465 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 INTS6-201ENST00000311234 3662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
PRAC1Q96KF2 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms