Protein–RNA interactions for Protein: Q96K76

USP47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, humanhuman

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Length 1,375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP47Q96K76 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
USP47Q96K76 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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