Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
COG3Q96JB2 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
COG3Q96JB2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms