Protein–RNA interactions for Protein: Q96J87

CELF6, CUGBP Elav-like family member 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF6Q96J87 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
CELF6Q96J87 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms