Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
RNF185Q96GF1 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms