Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
RNFT2Q96EX2 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RNFT2Q96EX2 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms