Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CELF1Q92879 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CELF1Q92879 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CELF1Q92879 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CELF1Q92879 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms