Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHW6

OTOS, Otospiralin, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOSQ8NHW6 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
OTOSQ8NHW6 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms