Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAJ2

C9orf106, Putative uncharacterized protein C9orf106, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106Q8NAJ2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
C9orf106Q8NAJ2 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C9orf106Q8NAJ2 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms