Protein–RNA interactions for Protein: Q8N205

SYNE4, Nesprin-4, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4Q8N205 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SYNE4Q8N205 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SYNE4Q8N205 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms