Protein–RNA interactions for Protein: Q8IUI4

SNX29P2, Putative protein SNX29P2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX29P2Q8IUI4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
SNX29P2Q8IUI4 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SNX29P2Q8IUI4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms