Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3Q1

SLC46A3, Solute carrier family 46 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A3Q7Z3Q1 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC46A3Q7Z3Q1 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC46A3Q7Z3Q1 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms