Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TMEM164Q5U3C3 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TMEM164Q5U3C3 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms