Protein–RNA interactions for Protein: Q587I9

SFT2D3, Vesicle transport protein SFT2C, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D3Q587I9 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SFT2D3Q587I9 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SFT2D3Q587I9 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms