Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
KLHL22Q53GT1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms