Protein–RNA interactions for Protein: Q52LD8

RFTN2, Raftlin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN2Q52LD8 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
RFTN2Q52LD8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
RFTN2Q52LD8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms