Protein–RNA interactions for Protein: Q4VX76

SYTL3, Synaptotagmin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL3Q4VX76 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SYTL3Q4VX76 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SYTL3Q4VX76 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms