Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CCDC96Q2M329 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCDC96Q2M329 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
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