Protein–RNA interactions for Protein: Q17RN3

FAM98C, Protein FAM98C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM98CQ17RN3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
FAM98CQ17RN3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FAM98CQ17RN3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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