Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ZNHIT3Q15649 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms