Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TRIP13Q15645 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms