Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

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Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PCOLCEQ15113 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCOLCEQ15113 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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