Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
HERC3Q15034 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms