Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GAPVD1Q14C86 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GAPVD1Q14C86 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
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