Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AP001198.2-201ENST00000593121 466 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
MKRN4PQ13434 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
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MKRN4PQ13434 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC079298.3-201ENST00000624941 977 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
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MKRN4PQ13434 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
MKRN4PQ13434 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
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