Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ITGB3BPQ13352 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms