Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CBX3Q13185 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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