Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
BPTFQ12830 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
BPTFQ12830 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
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